"Systems" в systems engineering по факту не считается множественным числом и объектом инженерии, а только "квалификацией", прилагательным -- что должно переводиться как "системная". Говорить "инженерия систем" неправильно, ибо systems engineering аналогично словосочетанию mechanical engineering и переводиться должно соответственно -- "системная инженерия".
При этом старая школа таки произносит и пишет system engineering, а новая школа -- исключительно systems engineering.