Несоответствие между IT-описанием и организационным описанием давно всех доканывает. Именно поэтому enterprise architecture популярно как инструмент айтишников, и непопулярно у менеджеров (это ведь "архитектура организации и... ее айтишной инфраструктуры" -- в одном определении конь и трепетная лань).
Мне кажется, без понимания IT-инфраструктуры (software services) как только части всей инфраструктуры тщетны все попытки выразить предприятие через сервисную структуру и через практики и процедуры, этой инфраструктурой поддерживаемые.
Онтологически -- это просто совмещение структурного/логического/функционального и процессного описаний (а ведь еще должно быть морфологическое/конструкторское/физическое описание), и тут нужно понимать, что в софте есть только часть структуры, часть морфологии и часть процессов (хотя с каждым годом все бОльшая и бОльшая часть). Именно над этим и нужно размышлять.
Эх, не намудрили бы они с новым SOA-манифестом (http://www.soa-manifesto.com/)...